По благословению Преосвященного митрополита Ростовского и Новочеркасского Меркурия, на основании решения Священного Синода от 29 октября 2019 г. (журнал №139), с 2020 года Донская духовная семинария реализует магистерскую программу «Государственно-конфессиональные отношения».

Магистерская программа ориентирована на подготовку специалистов в сфере взаимодействия Церкви с исполнительной, законодательной и судебной властями, муниципальными образованиями, казачьими структурами, Министерством обороны и Федеральной службой исполнения наказаний.

  Обучение в магистратуре направлено на повышение уровня теоретических и практических компетенций служителей и сотрудников религиозных организаций, контактирующих с органами государственной власти, представителей казачьих обществ, преподавателей образовательных заведений, административных работников, осуществляющих взаимодействие с религиозными организациями.

Высокий уровень профессорско-преподавательского состава Донской духовной семинарии и привлечение к учебному процессу практикующих специалистов обеспечивает получение глубоких знаний, необходимых для организационно-юридического, экспертно-консультационного сопровождения государственно-церковного партнерства.